Модуль АЛТЭЙ Микробиология разработан с целью наиболее полного охвата всех аспектов деятельности крупной микробиологической лаборатории. Модуль обеспечивает максимальный уровень автоматизации технологических процессов микробиологической лаборатории от момента поступления биоматериала до выдачи результатов и формирования эпидемиологических отчетов.
Основной функционал модуля АЛТЭЙ Микробиология:
• Ведение нормативно-справочной информации бактериологической лаборатории;
• Прием и регистрация заказов;
• Контроль качества поступивших проб, маркировка, штрих-кодирование, чашек;
• Учет посевов, высевов, пересевов;
• Исследование выросших колоний организмов;
• Постановка биохимических тестов идентификации вида организма;
• Анализ чувствительности к антибиотикам, бактериофагам, пробиотикам;
• Маркеры резистентности, тесты на фенотип;
• Применение встроенных экспертных систем;
• Работа с микробиологическими анализаторами и масс-спектрометрами;
• Эпидемиологические отчеты, отчетность по форме 30;
• Автоматизация санитарно-бактериологических исследований;
• Автоматизация музея культур;
• Автоматизация утилизации;
Модуль АЛТЭЙ Микробиология реализует автоматизацию микробиологической лаборатории на основе следующих нормативных документов:
• Приказ от 18 мая 2021 г. N 464н «Об утверждении правил проведения лабораторных исследований»
• Методические рекомендации. Методы бактериологического исследования условно-патогенных микроорганизмов в клинической микробиологии от 19 декабря 1991
• Приказ Минздрава РФ от 09.06.2003 N 231 «Об утверждении отраслевого стандарта «Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника»
• Приказ Федеральной службы государственной статистики №876 от от 31 декабря 2020 г. форма №30
• Приказ от 5 декабря 2005 года N 787 «Об утверждении инструкций к формам статистической отчетности»
• Методические рекомендации 4.2 0220 – 20 Методы санитарно-бактериологического исследования микробной обсеменённости объектов внешней среды;
• СанПиН 3.3686-21 "Санитарно-эпидемиологические требования по профилактике инфекционных болезней
Ведение нормативно справочной информации бактериологической лаборатории
Нормативно справочная информация для микробиологических исследований включает в себя большое количество справочников и экспертных правил. В ее состав входят сведения о видах исследуемых биоматериалов, средах для посевов, организмах, антибиотиках, тестах идентификации, панелях, экспертные правила и многое другое.
В выполнения проекта проведена работа по сбору данных и наполнению справочников в соответствии с современными отечественными и зарубежными нормативами.
Система поставляется со всей актуальной нормативно-справочной информацией, которая может потребоваться для работы.
Прием и регистрация заказов на лабораторные исследования
При регистрации заказа вносятся:
• сведения о пациенте, включая все необходимые адресно-паспортные сведения и направительный диагноз для последующего учета по ОМС или для учета платных услуг;
• сведения о заказчике, заказавшем враче;
• заказанные услуги с уточнением вида материала, времени и места взятия, отметками о качестве поступивших проб.
Заказ может быть получен в электронном виде из локальной или региональной медицинской системы. Например, из ЕМИАС в Москве, из ОДЛИ в Петербурге, из шины Netrika, используемой во множестве других регионов и других региональных медицинских систем.
Журнал посевов
Зарегистрированные заказы попадают в Журнал посевов, который позволяет отслеживать ход выполнения и статус готовности результатов.
Пробы и заказы автоматически нумеруются, маркируются штрих-кодом и распределяются по рабочим группам микробиологической лаборатории. Выполняется контроль качества и отбраковка поступающих проб.
Далее с помощью журнала посевов отслеживается статус выполнения каждого исследования.
Назначение наборов сред
В зависимости от заказанных услуг, биоматериалов, характеристик пациента система определяет, на какие среды требуется сделать посевы или высевы в соответствии с действующими нормативными документами и может их автоматически назначать. Также сотрудники лаборатории могут выбирать и дополнять наборы сред для посева в конкретной ситуации.
Выполняется автоматическая нумерация чашек. Система позволяет гибко настроить правила нумерации, используемые лабораторией.
Работа с чашками
Эффективная работа с чашками обеспечивается за счёт автоматического назначения наборов чашек на исследование и возможности потоковой нумерации и штрих-кодовой маркировки посевных чашек до поступления заказов.
Результаты первичного роста оперативно регистрируются с помощью механизма групповой отметки роста.
Работа с колониями
Система обеспечивает учет исследования выросших колоний, включая:
• Маркировку чашек с колониями;
• Регистрацию морфологии и микроскопии с использованием вариантов и шаблонов;
• Регистрацию пересевов колоний с дополнительной нумерацией и маркировкой чашек;
• Автоматическое и ручное назначение дифференциальных панелей и тестов;
• Автоматическое и ручное назначение панелей идентификации;
• Регистрация результатов тестов.
При настройке панелей задаются правила, автоматически определяющие вид организма в зависимости от сочетания результатов биохимических тестов.
В библиотеку панелей идентификации внесены все основные виды панелей.
Имеется возможность назначать и фиксировать результаты дополнительных уточняющих тестов.
Анализ чувствительности организмов
На стадии анализа чувствительности обеспечивается:
• Назначение панелей антибиотиков, бактериофагов, пробиотиков;
• Автоматическое и ручное назначение и дополнение панелей;
• Регистрация и оценка результатов чувствительности культур к антибиотикам в ручном режиме и с использованием анализаторов;
• Постановка тестов на фенотип;
• Постановка маркеров резистентности;
Встроенные экспертные системы
Система содержит данные различных экспертных система МУК, EUCAST, CLSI и других и поддерживает их актуальные обновления. С помощью экспертных систем производится интерпретация данных диаметров зон задержки роста и минимальной ингибирующей концентрации в чувствительности к антибиотикам.
Также на основе экспертных систем выполняется автоматическая проверка результатов анализа чувствительности на соответствие базе знаний о природной устойчивости микроорганизмов, приобретенной резистентности и клинической эффективности антибиотиков. Система предлагает исправления степени чувствительности.
На основе рекомендаций экспертных систем могут автоматически добавляться маркеры резистентности, выдаваться предупреждения и пояснения к результатам.
Экспертные правила на основе следующих источников:
• Руководство по клинической лабораторной диагностики «Определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам» от 17.10.2015 г.
• Клинические рекомендации «Определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам» от 03.2018.Рекомендации МАКМАХ «Определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам (2021)»
• «Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing» 32th Edition (Clinical and laboratory standards institute).
• European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST), v 13.0.
Работа с лабораторным оборудованием
Система поддерживает работу с бактериологическим оборудованием Biomerieux, Bio-Rad Laboratories, Becton Dickinson, DADE BEHRING и другими, включая автоматические анализаторы, масс-спектрометры и посевные станции.
Использование масс-спектрометров
При работе с масс-спектрометром система обеспечивает:
- формирование протоколов мишеней с использованием штрих-кодов;
- автоматический прием с масс-спектрометра данных измерений;
- выбор наиболее вероятного варианта организма из результатов масс-спектрометра.
Выдача результатов исследований
Система укомплектована готовыми шаблонами бланков результатов, имеет встроенный дизайнер бланков, позволяющий быстро адаптировать выходные документы к требованию своей организации и организаций заказчиков.
Реализована поддержка процессов верификации и утверждения результатов ответственным сотрудником, электронная цифровая подпись (ЭЦП).
Результаты исследований выдаются в печатном виде, передаются по электронной почте. Предусмотрена передача SMS извещений о готовности результатов.
Результаты могут передаваться в МИС и региональные МИС в формате СЭМД CDA R2.0. Поддерживаются такие РМИС как «1С:Медицина.Регион», Netrika, ЕМИАС, ОДЛИ и другие.
Для обмена данными с другими системами применяется кодирование информации на основе автоматически обновляемых с сайта Минздрава Федеральных справочников лабораторных исследований (ФСЛИ).
Эпидемиологические отчеты
В системе реализован объемный комплект статистической и эпидемиологической отчетности микробиологической лаборатории, а также общая отчетность медицинской организации по форме 30.
Отчетность реализована согласно нормативным документам:
• Форма №30. Приказ Федеральной службы государственной статистики №876 от 31 декабря 2020 г.
• Приказ N 787 «Об утверждении инструкций к формам статистической отчетности» от 5 декабря 2005 года
• ПРИКАЗ N 775 Об утверждении форм отраслевого статистического наблюдения от 18 ноября 2005 года (с изменениями на 22 марта 2007 года)
Основной функционал модуля АЛТЭЙ Микробиология:
• Ведение нормативно-справочной информации бактериологической лаборатории;
• Прием и регистрация заказов;
• Контроль качества поступивших проб, маркировка, штрих-кодирование, чашек;
• Учет посевов, высевов, пересевов;
• Исследование выросших колоний организмов;
• Постановка биохимических тестов идентификации вида организма;
• Анализ чувствительности к антибиотикам, бактериофагам, пробиотикам;
• Маркеры резистентности, тесты на фенотип;
• Применение встроенных экспертных систем;
• Работа с микробиологическими анализаторами и масс-спектрометрами;
• Эпидемиологические отчеты, отчетность по форме 30;
• Автоматизация санитарно-бактериологических исследований;
• Автоматизация музея культур;
• Автоматизация утилизации;
Модуль АЛТЭЙ Микробиология реализует автоматизацию микробиологической лаборатории на основе следующих нормативных документов:
• Приказ от 18 мая 2021 г. N 464н «Об утверждении правил проведения лабораторных исследований»
• Методические рекомендации. Методы бактериологического исследования условно-патогенных микроорганизмов в клинической микробиологии от 19 декабря 1991
• Приказ Минздрава РФ от 09.06.2003 N 231 «Об утверждении отраслевого стандарта «Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника»
• Приказ Федеральной службы государственной статистики №876 от от 31 декабря 2020 г. форма №30
• Приказ от 5 декабря 2005 года N 787 «Об утверждении инструкций к формам статистической отчетности»
• Методические рекомендации 4.2 0220 – 20 Методы санитарно-бактериологического исследования микробной обсеменённости объектов внешней среды;
• СанПиН 3.3686-21 "Санитарно-эпидемиологические требования по профилактике инфекционных болезней
Ведение нормативно справочной информации бактериологической лаборатории
Нормативно справочная информация для микробиологических исследований включает в себя большое количество справочников и экспертных правил. В ее состав входят сведения о видах исследуемых биоматериалов, средах для посевов, организмах, антибиотиках, тестах идентификации, панелях, экспертные правила и многое другое.
В выполнения проекта проведена работа по сбору данных и наполнению справочников в соответствии с современными отечественными и зарубежными нормативами.
Система поставляется со всей актуальной нормативно-справочной информацией, которая может потребоваться для работы.
Прием и регистрация заказов на лабораторные исследования
При регистрации заказа вносятся:
• сведения о пациенте, включая все необходимые адресно-паспортные сведения и направительный диагноз для последующего учета по ОМС или для учета платных услуг;
• сведения о заказчике, заказавшем враче;
• заказанные услуги с уточнением вида материала, времени и места взятия, отметками о качестве поступивших проб.
Заказ может быть получен в электронном виде из локальной или региональной медицинской системы. Например, из ЕМИАС в Москве, из ОДЛИ в Петербурге, из шины Netrika, используемой во множестве других регионов и других региональных медицинских систем.
Журнал посевов
Зарегистрированные заказы попадают в Журнал посевов, который позволяет отслеживать ход выполнения и статус готовности результатов.
Пробы и заказы автоматически нумеруются, маркируются штрих-кодом и распределяются по рабочим группам микробиологической лаборатории. Выполняется контроль качества и отбраковка поступающих проб.
Далее с помощью журнала посевов отслеживается статус выполнения каждого исследования.
Назначение наборов сред
В зависимости от заказанных услуг, биоматериалов, характеристик пациента система определяет, на какие среды требуется сделать посевы или высевы в соответствии с действующими нормативными документами и может их автоматически назначать. Также сотрудники лаборатории могут выбирать и дополнять наборы сред для посева в конкретной ситуации.
Выполняется автоматическая нумерация чашек. Система позволяет гибко настроить правила нумерации, используемые лабораторией.
Работа с чашками
Эффективная работа с чашками обеспечивается за счёт автоматического назначения наборов чашек на исследование и возможности потоковой нумерации и штрих-кодовой маркировки посевных чашек до поступления заказов.
Результаты первичного роста оперативно регистрируются с помощью механизма групповой отметки роста.
Работа с колониями
Система обеспечивает учет исследования выросших колоний, включая:
• Маркировку чашек с колониями;
• Регистрацию морфологии и микроскопии с использованием вариантов и шаблонов;
• Регистрацию пересевов колоний с дополнительной нумерацией и маркировкой чашек;
• Автоматическое и ручное назначение дифференциальных панелей и тестов;
• Автоматическое и ручное назначение панелей идентификации;
• Регистрация результатов тестов.
При настройке панелей задаются правила, автоматически определяющие вид организма в зависимости от сочетания результатов биохимических тестов.
В библиотеку панелей идентификации внесены все основные виды панелей.
Имеется возможность назначать и фиксировать результаты дополнительных уточняющих тестов.
Анализ чувствительности организмов
На стадии анализа чувствительности обеспечивается:
• Назначение панелей антибиотиков, бактериофагов, пробиотиков;
• Автоматическое и ручное назначение и дополнение панелей;
• Регистрация и оценка результатов чувствительности культур к антибиотикам в ручном режиме и с использованием анализаторов;
• Постановка тестов на фенотип;
• Постановка маркеров резистентности;
Встроенные экспертные системы
Система содержит данные различных экспертных система МУК, EUCAST, CLSI и других и поддерживает их актуальные обновления. С помощью экспертных систем производится интерпретация данных диаметров зон задержки роста и минимальной ингибирующей концентрации в чувствительности к антибиотикам.
Также на основе экспертных систем выполняется автоматическая проверка результатов анализа чувствительности на соответствие базе знаний о природной устойчивости микроорганизмов, приобретенной резистентности и клинической эффективности антибиотиков. Система предлагает исправления степени чувствительности.
На основе рекомендаций экспертных систем могут автоматически добавляться маркеры резистентности, выдаваться предупреждения и пояснения к результатам.
Экспертные правила на основе следующих источников:
• Руководство по клинической лабораторной диагностики «Определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам» от 17.10.2015 г.
• Клинические рекомендации «Определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам» от 03.2018.Рекомендации МАКМАХ «Определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам (2021)»
• «Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing» 32th Edition (Clinical and laboratory standards institute).
• European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST), v 13.0.
Работа с лабораторным оборудованием
Система поддерживает работу с бактериологическим оборудованием Biomerieux, Bio-Rad Laboratories, Becton Dickinson, DADE BEHRING и другими, включая автоматические анализаторы, масс-спектрометры и посевные станции.
Использование масс-спектрометров
При работе с масс-спектрометром система обеспечивает:
- формирование протоколов мишеней с использованием штрих-кодов;
- автоматический прием с масс-спектрометра данных измерений;
- выбор наиболее вероятного варианта организма из результатов масс-спектрометра.
Выдача результатов исследований
Система укомплектована готовыми шаблонами бланков результатов, имеет встроенный дизайнер бланков, позволяющий быстро адаптировать выходные документы к требованию своей организации и организаций заказчиков.
Реализована поддержка процессов верификации и утверждения результатов ответственным сотрудником, электронная цифровая подпись (ЭЦП).
Результаты исследований выдаются в печатном виде, передаются по электронной почте. Предусмотрена передача SMS извещений о готовности результатов.
Результаты могут передаваться в МИС и региональные МИС в формате СЭМД CDA R2.0. Поддерживаются такие РМИС как «1С:Медицина.Регион», Netrika, ЕМИАС, ОДЛИ и другие.
Для обмена данными с другими системами применяется кодирование информации на основе автоматически обновляемых с сайта Минздрава Федеральных справочников лабораторных исследований (ФСЛИ).
Эпидемиологические отчеты
В системе реализован объемный комплект статистической и эпидемиологической отчетности микробиологической лаборатории, а также общая отчетность медицинской организации по форме 30.
Отчетность реализована согласно нормативным документам:
• Форма №30. Приказ Федеральной службы государственной статистики №876 от 31 декабря 2020 г.
• Приказ N 787 «Об утверждении инструкций к формам статистической отчетности» от 5 декабря 2005 года
• ПРИКАЗ N 775 Об утверждении форм отраслевого статистического наблюдения от 18 ноября 2005 года (с изменениями на 22 марта 2007 года)